دوره­ی تابستانی المپیادهای علمی کشور هر ساله از ابتدای فصل تابستان به مدت هشت تا ده هفته در باشگاه دانش­پژوهان جوان برگزار می­گردد. در دوره­ی تابستانی المپیاد کامپیوتر حدود ۳۰ نفر از دانش­پژوهانی که بالاترین نمره کل را در آزمون­های مرحله­ی اول، دوم و برنامه نویسی کسب کنند حضور خواهند داشت. در محاسبه­ی نمره­ی کل، آزمون­های مرحله­ی دوم و آزمون برنامه نویسی حائز اهمیت می­باشند.

در این دوره مباحثی از قبیل مبانی داده­ساختارها و الگوریتم­ها، نظریه­ی گراف­ها، ترکیبیات و برنامه­نویسی پیشرفته و همچنین برنامه­نویسی عملی مسائل المپیاد کامپیوتر تدریس می­گردند. این دوره علاوه بر آن­که دانش­پژوهان را برای حضور در مراحل بعدی المپیاد کامپیوتر آماده می­کند، برای افرادی که قصد ادامه­ی تحصیل در رشته­ی مهندسی کامپیوتر یا رشته­های مرتبط را داشته باشند بسیار مفید و موثر است.

در طول دوره آزمون­های متعدد نظری و عملی برگزار می­گردد. افرادی که در سال­های قبل مدال طلای المپیاد کشوری کامپیوتر را کسب نموده­اند در این دوره شرکت نخواهند کرد و در صورت حضور در مقطع متوسطه مستقیما به دوره انتخاب تیم ملی راه می­یابند. در عین حال متن دروس و سوال­های امتحانات دوره تابستانی روی وب­گاه المپیاد کامپیوتر در اختیار عموم قرار می­گیرد.

در پایان دوره­ی تابستانی ۸ نفر از دانش­پژوهان که در مجموع بالاترین نمره را کسب نمایند مدال طلای المپیاد کشوری کامپیوتر دریافت می­کنند. حدود نیمی از سایر دانش­پژوهان مدال نقره و نیم دیگر مدال برنز کشوری کسب می­کنند. در صورتی که مجموع نمرات یک فرد پایین­تر از حد نصاب تعریف شده باشد ممکن است به جای مدال تنها گواهی شرکت در دوره­ی تابستانی به وی اعطا شود.